O tempo condiciona, o trópico de Capricórnio que divide a província em dois meio, a altitude comum das regiões e a topografia faz o contraste no clima da província. Varia do vidraceiro frio do Altiplane para o clima morno do de de Quebrada Humahuaca ou o tropical dos vales do rio de São Francisco. No mesmo dia, a temperatura pode ser 45º e 25º centígrado em verão, enquanto a pôr-do-sol as temperaturas puderem estar abaixo de zero na região do Altiplane e as montanhas mais altas.

A Altitude do Puna marca um clima frio e seco a maioria do ano, enquanto as passagens e vales têm um clima melhor. O clima tropical é típico do vale de São Francisco e as regiões vizinhas. As chuvas comuns alcançam o 900 mm por ano.